DNA親和純化測序技術（DAP-seq）——近期發(fā)表的文章

在功能基因組學和表觀遺傳學研究中，轉錄因子結合位點（TFBS）的發(fā)掘一直是研究熱點。傳統(tǒng)的ChIP-seq（染色質免疫共沉淀測序）方法，在抗體質量很好的情況下能夠有效檢測到TFBS。然而，好的抗體可遇不可求，這限制了ChIP-seq更廣泛的應用。

DAP-seq技術的出現(xiàn)，使TFBS 的研究不再局限于物種，不再受抗體質量的限制，為生命科學領域轉錄因子的研究提供了新的有效工具。

藍景科信為您提供DAP-seq全流程技術服務和個性化數(shù)據(jù)分析，具有100多個物種，500多個轉錄因子的實戰(zhàn)經(jīng)驗。歡迎咨詢。

已做物種

植物：

擬南芥、莖瘤芥、甘藍型油菜、白菜型油菜、不結球白菜、菜心、小麥、大麥、花生、辣椒、番茄、草莓、黃花棘豆、苦蕎、紅薯、木薯、馬鈴薯、普通煙草、人參、鴨茅、yingsu、甘蔗、短芒大麥草、二色補血草、煙草、百脈根、芍藥、丹參、狗尾草、菠菜、玉米、大豆、高粱、藜麥、陸地棉、甜瓜、黃瓜、葡萄、灰氈毛忍冬、粉葛、三葉青、獼猴桃、香蕉、蒺藜苜蓿、紫花苜蓿、伴礦景天、苔蘚、地錢、毛果楊、717楊、84K楊、小黑楊、胡楊、山新楊、小葉楊、歐美楊、大青楊、毛白楊、剛毛檉柳、白樺、光皮樺、油松、毛竹、麻竹、銀杏、油桐、荔枝、柑橘、甜橙、歐洲云杉、核桃、柿子、閩楠、木荷、臍橙、板栗、棗、枳、杜梨、蘋果、桃、櫻桃、麻瘋樹、茶樹、梅、月季、海島棉

動物：

驢、飛蝗、新孢子蟲

真菌：

擬輪枝鐮孢菌、豬苓真菌、意大利青霉、草酸青霉、腐霉、金黃殼囊孢、靈芝、糙皮側耳、草菇、灰蓋鬼傘、蟲草、亞洲鐮刀菌

細菌：

路德維希腸桿菌、嗜熱厭氧桿菌、生氮假單胞菌、伯克赫爾德氏菌、布魯氏菌、肺炎克雷伯菌

以下是近期藍景科信的客戶發(fā)表的DAP-seq相關文章：

2022年10月，浙江大學農(nóng)業(yè)與生物技術學院宋鳳鳴課題組的最新研究成果，發(fā)表在學術期刊Journal of Integrative Plant Biology（IF=9.106）上，文章題目為“The NAC transcription factor ONAC083 negatively regulates rice immunity against Magnaporthe oryzae by directly activating transcription of the RING-H2 gene OsRFPH2-6"。該研究使用DNA親和純化測序(DAP-seq) 技術鑒定了水稻中轉錄因子ONAC083的結合基序和靶基因。進一步研究揭示了OsNAC083通過結合ACGCAA元件影響OsRFPH2-6轉錄，進而負調控水稻對稻瘟病的抗性。

2022年9月，中國熱帶農(nóng)業(yè)科學院熱帶生物技術研究所功能基因研究組在雜志Plant Biotechnology Journal（IF=13.263）在線發(fā)表了題為 “A CC-type glutaredoxin, MeGRXC3, associates with catalases and negatively regulates drought tolerance in cassava (Manihot esculenta Crantz)" 的研究論文，證實了CC類谷氧還蛋白MeGRXC3可以在轉錄和轉錄后水平調控過氧化氫酶的活性、影響過氧化氫在葉片表皮不同類型細胞中的分布，從而調控木薯對干旱脅迫的響應。

2022年8月，廣西大學農(nóng)學院甘蔗生物學重點實驗室/亞熱帶農(nóng)業(yè)生物資源保護與利用國家重點實驗室張木清/姚偉研究團隊在

Journal of Experimental Botany（IF=7.298）在線發(fā)表了題為“ScAIL1 modulates plant defense responses by targeting DELLA and regulating GA and JA signaling"的研究論文，該研究發(fā)現(xiàn)了一個甘蔗新的AP2家族轉錄因子ScAIL1，通過靶向DELLA調節(jié)JA與GA合成，平衡植物生長與防御。

2022年8月，安徽農(nóng)業(yè)大學、中國水稻研究所和上海市農(nóng)業(yè)科學院作物育種栽培研究所在The Plant Journal（IF=5.726）期刊聯(lián)合發(fā)表了題為“OsSGT1 promotes melatonin-ameliorated seed tolerance to chromium stress by affecting the OsABI5-OsAPX1 transcriptional module in rice"的文章，揭示了OsSGT1和ABI5相互作用，調控OsAPX1的表達，促進褪黑素改善種子在鉻污染條件下萌發(fā)的分子機制。

2022年8月，揚州大學生物科學與技術學院、植物功能基因組學教育部重點實驗室高勇課題組在The Plant Cell（IF=12.085）上在線發(fā)表了題為“Phytochrome Interacting Factor Regulates Stomatal Aperture by Coordinating Red Light and Abscisic Acid"的研究論文，揭示了光敏色素互作因子（phytochrome interacting factors, PIFs）通過協(xié)調紅光和脫落酸（ABA）信號調節(jié)氣孔開度的分子機制。

2022年7月，北京市農(nóng)林科學院玉米DNA指紋及分子育種北京市重點實驗室、齊魯師范大學玉米分子育種研究院的共同研究成果，在學術期刊Theoretical and Applied Genetics(IF=5.574)上發(fā)表，題目為“ A newly characterized allele of ZmR1 increases anthocyanin content in whole maize plant and the regulation mechanism of diferent ZmR1 alleles"。本文主要研究內(nèi)容是鑒定了玉米花青素合成相關等位基因ZmR1CQ01，并揭示了3個ZmR1等位基因的生物學功能和分子調控機制。

2022年5月，中科院植物所王雷研究組在Plant Physiology（IF=8.005）期刊上發(fā)表了題為“Rice CIRCADIAN CLOCK ASSOCIATED1 transcriptionally regulates ABA signaling to confer multiple abiotic stress tolerance"的研究成果。該研究揭示了OsCCA1調控水稻適應鹽脅迫、干旱脅迫以及滲透脅迫的分子機制。其中，該研究使用了DNA親和純化測序技術（DAP-seq，DNA Affinity Purification Sequencing），鑒定了水稻生物鐘核心組分OsCCA1（Oryza sativa CIRCADIAN CLOCK ASSOCIATED 1）調控的下游靶基因。

2020年4月，北京工商大學與藍景科信合作，Biochemical and Biophysical Research Communications（IF=3.322）發(fā)表了題為“ Phytochrome-interacting factors regulate seedling growth through ABA signaling"的文章，為揭示PIFs轉錄因子調控ABA信號轉導機制提供了重要線索。

2019年9月，北京林業(yè)大學和藍景科信合作，在植物學主流學術期刊Journal of Experimental Botany上（IF=5.36），發(fā)表了題為“Populus euphratica WRKY1 binds the promoter of H±ATPase gene to enhance gene expression and salt tolerance"的研究成果。該研究借助DNA親和純化測序（DNA Affinity Purification Sequencing，DAP-seq）技術，深入揭示了胡楊耐鹽的分子機制。